Yo para cosas sencillas utilizo
GifBuilder pero necesitas tener preparados los fotogramas...
Si lo voy haciendo sobre la marcha lo preparo en ImageReady, el programa para edición de imágenes que viene con Photoshop...
GifBuilder es sencillo de utilizar, nada que explicar... arrastrar los fotogramas, poner tiempo entre ellos, alguna transición y punto...
En imageready se hace con la "linea de tiempo", incluyendo fotogramas y activando las capas que quieras que aparezcan en cada uno de ellos... también hace transiciones... y claro... en la ventana de optimizar, indicar que el formato de salida es un gif...
Creo que utilizas PC, y GifBuilder es para Mac, me imagino que habrá cosas para PC... yo suelo buscar en
http://www.versiontracker.com